Protein–RNA interactions for Protein: Q96K58

ZNF668, Zinc finger protein 668, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF668Q96K58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF668Q96K58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF668Q96K58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF668Q96K58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF668Q96K58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF668Q96K58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF668Q96K58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms