Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX1

TCTN2, Tectonic-2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN2Q96GX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN2Q96GX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN2Q96GX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCTN2Q96GX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCTN2Q96GX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN2Q96GX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms