Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEH1LQ96EE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEH1LQ96EE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEH1LQ96EE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEH1LQ96EE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms