Protein–RNA interactions for Protein: Q96A44

SPSB4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB4Q96A44 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPSB4Q96A44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB4Q96A44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB4Q96A44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB4Q96A44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms