Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGP1Q92546 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGP1Q92546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGP1Q92546 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms