Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf40Q8WZ69 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf40Q8WZ69 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf40Q8WZ69 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf40Q8WZ69 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf40Q8WZ69 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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