Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREK1Q8WXA9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREK1Q8WXA9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREK1Q8WXA9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREK1Q8WXA9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREK1Q8WXA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms