Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF2Q8TEC5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3RF2Q8TEC5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF2Q8TEC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF2Q8TEC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms