Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MDM1Q8TC05 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MDM1Q8TC05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM1Q8TC05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM1Q8TC05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDM1Q8TC05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDM1Q8TC05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms