Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB3IL1Q8TBN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB3IL1Q8TBN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3IL1Q8TBN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB3IL1Q8TBN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms