Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB22

SPATA20, Spermatogenesis-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20Q8TB22 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPATA20Q8TB22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA20Q8TB22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPATA20Q8TB22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPATA20Q8TB22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA20Q8TB22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms