Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTLL11Q8NHH1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TTLL11Q8NHH1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TTLL11Q8NHH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TTLL11Q8NHH1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTLL11Q8NHH1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTLL11Q8NHH1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms