Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FUNDC1Q8IVP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FUNDC1Q8IVP5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FUNDC1Q8IVP5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FUNDC1Q8IVP5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FUNDC1Q8IVP5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FUNDC1Q8IVP5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FUNDC1Q8IVP5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms