Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHFQ7M4L6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHFQ7M4L6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHFQ7M4L6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms