Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDPD3Q7L5L3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDPD3Q7L5L3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDPD3Q7L5L3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms