Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP6Q6ZN66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP6Q6ZN66 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP6Q6ZN66 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP6Q6ZN66 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP6Q6ZN66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GBP6Q6ZN66 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP6Q6ZN66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms