Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGALS9CQ6DKI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LGALS9CQ6DKI2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LGALS9CQ6DKI2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LGALS9CQ6DKI2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms