Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG16L1Q676U5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG16L1Q676U5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L1Q676U5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG16L1Q676U5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms