Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF8Q5VWM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF8Q5VWM4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF8Q5VWM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF8Q5VWM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms