Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN2Q52LD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN2Q52LD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN2Q52LD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFTN2Q52LD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFTN2Q52LD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms