Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC6LQ2NKX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC6LQ2NKX8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC6LQ2NKX8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms