Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDK4Q16654 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDK4Q16654 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDK4Q16654 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDK4Q16654 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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