Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX1AQ16623 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STX1AQ16623 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
STX1AQ16623 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX1AQ16623 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
STX1AQ16623 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STX1AQ16623 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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