Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STX1AQ16623 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
STX1AQ16623 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
STX1AQ16623 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
STX1AQ16623 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
STX1AQ16623 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
STX1AQ16623 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STX1AQ16623 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
STX1AQ16623 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
STX1AQ16623 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
STX1AQ16623 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
STX1AQ16623 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STX1AQ16623 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STX1AQ16623 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STX1AQ16623 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
STX1AQ16623 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
STX1AQ16623 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
STX1AQ16623 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
STX1AQ16623 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
STX1AQ16623 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
STX1AQ16623 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
STX1AQ16623 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
STX1AQ16623 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STX1AQ16623 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STX1AQ16623 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
STX1AQ16623 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
STX1AQ16623 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
STX1AQ16623 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
STX1AQ16623 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
STX1AQ16623 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
STX1AQ16623 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STX1AQ16623 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STX1AQ16623 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
STX1AQ16623 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
STX1AQ16623 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
STX1AQ16623 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STX1AQ16623 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STX1AQ16623 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STX1AQ16623 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STX1AQ16623 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
STX1AQ16623 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STX1AQ16623 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
STX1AQ16623 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STX1AQ16623 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
STX1AQ16623 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
STX1AQ16623 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
STX1AQ16623 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STX1AQ16623 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STX1AQ16623 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STX1AQ16623 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STX1AQ16623 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STX1AQ16623 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STX1AQ16623 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STX1AQ16623 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STX1AQ16623 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STX1AQ16623 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STX1AQ16623 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STX1AQ16623 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
STX1AQ16623 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
STX1AQ16623 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
STX1AQ16623 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STX1AQ16623 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
STX1AQ16623 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STX1AQ16623 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STX1AQ16623 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STX1AQ16623 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STX1AQ16623 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
STX1AQ16623 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STX1AQ16623 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STX1AQ16623 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
STX1AQ16623 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
STX1AQ16623 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STX1AQ16623 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STX1AQ16623 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
STX1AQ16623 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STX1AQ16623 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
STX1AQ16623 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
STX1AQ16623 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STX1AQ16623 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
STX1AQ16623 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms