Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAPC1Q16533 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC1Q16533 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAPC1Q16533 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms