Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D1Q15714 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D1Q15714 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TSC22D1Q15714 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC22D1Q15714 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms