Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN3Q15417 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN3Q15417 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNN3Q15417 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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