Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NECTIN1Q15223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NECTIN1Q15223 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NECTIN1Q15223 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NECTIN1Q15223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms