Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NECTIN1Q15223 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NECTIN1Q15223 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
NECTIN1Q15223 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NECTIN1Q15223 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NECTIN1Q15223 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NECTIN1Q15223 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NECTIN1Q15223 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NECTIN1Q15223 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NECTIN1Q15223 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NECTIN1Q15223 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NECTIN1Q15223 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NECTIN1Q15223 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NECTIN1Q15223 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NECTIN1Q15223 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NECTIN1Q15223 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NECTIN1Q15223 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NECTIN1Q15223 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NECTIN1Q15223 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NECTIN1Q15223 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NECTIN1Q15223 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NECTIN1Q15223 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NECTIN1Q15223 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NECTIN1Q15223 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NECTIN1Q15223 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NECTIN1Q15223 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NECTIN1Q15223 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NECTIN1Q15223 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NECTIN1Q15223 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NECTIN1Q15223 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NECTIN1Q15223 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NECTIN1Q15223 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NECTIN1Q15223 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NECTIN1Q15223 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NECTIN1Q15223 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NECTIN1Q15223 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NECTIN1Q15223 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NECTIN1Q15223 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NECTIN1Q15223 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NECTIN1Q15223 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NECTIN1Q15223 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NECTIN1Q15223 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NECTIN1Q15223 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NECTIN1Q15223 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NECTIN1Q15223 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NECTIN1Q15223 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NECTIN1Q15223 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NECTIN1Q15223 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NECTIN1Q15223 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NECTIN1Q15223 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NECTIN1Q15223 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NECTIN1Q15223 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NECTIN1Q15223 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NECTIN1Q15223 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NECTIN1Q15223 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NECTIN1Q15223 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NECTIN1Q15223 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NECTIN1Q15223 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NECTIN1Q15223 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NECTIN1Q15223 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NECTIN1Q15223 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NECTIN1Q15223 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
NECTIN1Q15223 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NECTIN1Q15223 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NECTIN1Q15223 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NECTIN1Q15223 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NECTIN1Q15223 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NECTIN1Q15223 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NECTIN1Q15223 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NECTIN1Q15223 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NECTIN1Q15223 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NECTIN1Q15223 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NECTIN1Q15223 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NECTIN1Q15223 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NECTIN1Q15223 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NECTIN1Q15223 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NECTIN1Q15223 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NECTIN1Q15223 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NECTIN1Q15223 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NECTIN1Q15223 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NECTIN1Q15223 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NECTIN1Q15223 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NECTIN1Q15223 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NECTIN1Q15223 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NECTIN1Q15223 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NECTIN1Q15223 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NECTIN1Q15223 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NECTIN1Q15223 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NECTIN1Q15223 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NECTIN1Q15223 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NECTIN1Q15223 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NECTIN1Q15223 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NECTIN1Q15223 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NECTIN1Q15223 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NECTIN1Q15223 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms