Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMCO1Q147U7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMCO1Q147U7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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