Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPRIN1Q14444 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN1Q14444 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPRIN1Q14444 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
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