Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CACNA1SQ13698 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNA1SQ13698 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CACNA1SQ13698 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CACNA1SQ13698 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNA1SQ13698 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms