Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXO1Q12778 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO1Q12778 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXO1Q12778 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXO1Q12778 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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