Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NMD5YJR132W 3147 nt7.87□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 MHF1YOL086W-A 273 nt7.86□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 VTS1YOR359W 1572 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 YEL008WYEL008W 381 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 FUN14YAL008W 597 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 MGM101YJR144W 810 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 EMC3YKL207W 762 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 YBL095WYBL095W 813 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 THI3YDL080C 1830 nt7.85□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 TPC1YGR096W 945 nt7.84□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 ADE17YMR120C 1779 nt7.84□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 PPS1YBR276C 2424 nt7.83□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 AGP2YBR132C 1791 nt7.83□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 SAN1YDR143C 1833 nt7.82□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 YOR389WYOR389W 1875 nt7.82□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 MLS1YNL117W 1665 nt7.82□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 YMR210WYMR210W 1350 nt7.82□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 POT1YIL160C 1254 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 APT1YML022W 564 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 TAF13YML098W 504 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 RCF2YNR018W 675 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 YMC2YBR104W 990 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 GGA2YHR108W 1758 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 AAT1YKL106W 1356 nt7.81□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 TRR1YDR353W 960 nt7.8□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 SBP1YHL034C 885 nt7.8□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 APS2YJR058C 444 nt7.8□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.79□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 NAM8YHR086W 1572 nt7.79□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 SSC1YJR045C 1965 nt7.79□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 BNA3YJL060W 1335 nt7.78□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 LEU2YCL018W 1095 nt7.78□□□□□ -1.16
NFI1Q12216 SRP54YPR088C 1626 nt7.77□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 ASN2YGR124W 1719 nt7.76□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 YER137CYER137C 447 nt7.76□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 SGE1YPR198W 1632 nt7.75□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.75□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 ESS1YJR017C 513 nt7.75□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 UBP13YBL067C 2244 nt7.74□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 ECM30YLR436C 3825 nt7.73□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 NIF3YGL221C 867 nt7.73□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 MRS4YKR052C 915 nt7.73□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 SPE2YOL052C 1191 nt7.73□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 GAS1YMR307W 1680 nt7.72□□□□□ -1.17
NFI1Q12216 REX2YLR059C 810 nt7.71□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 PTC6YCR079W 1329 nt7.71□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 KRE1YNL322C 942 nt7.7□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 ERG12YMR208W 1332 nt7.7□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 RRT6YGL146C 936 nt7.69□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 GSF2YML048W 1212 nt7.69□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 YOS9YDR057W 1629 nt7.69□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 PDC6YGR087C 1692 nt7.69□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 TUB4YLR212C 1422 nt7.69□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 NAS2YIL007C 663 nt7.68□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 STE4YOR212W 1272 nt7.68□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 PAB1YER165W 1734 nt7.68□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 WSC4YHL028W 1818 nt7.67□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 snR86snR86 1004 nt7.67□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.67□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 YLR349WYLR349W 507 nt7.65□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 THP3YPR045C 1413 nt7.65□□□□□ -1.18
NFI1Q12216 CIR2YOR356W 1896 nt7.64□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 CPD1YGR247W 720 nt7.64□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YKR012CYKR012C 378 nt7.64□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 VBA5YKR105C 1749 nt7.64□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YKR018CYKR018C 2178 nt7.63□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YPT11YNL304W 1254 nt7.63□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 LEA1YPL213W 717 nt7.63□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 TMS1YDR105C 1422 nt7.62□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YEN1YER041W 2280 nt7.62□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 NME1NME1 340 nt7.62□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 TGL5YOR081C 2250 nt7.62□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YLL058WYLL058W 1728 nt7.61□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 CDD1YLR245C 429 nt7.61□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 FSH2YMR222C 672 nt7.61□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YIP4YGL198W 708 nt7.6□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 YJL009WYJL009W 327 nt7.6□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 ABP1YCR088W 1779 nt7.6□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 RPL12BYDR418W 498 nt7.59□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 MET8YBR213W 825 nt7.59□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 DAL7YIR031C 1665 nt7.59□□□□□ -1.19
NFI1Q12216 VMA2YBR127C 1554 nt7.59□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 SDS24YBR214W 1584 nt7.59□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 PPZ2YDR436W 2133 nt7.58□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 VBA3YCL069W 1377 nt7.58□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 SGF73YGL066W 1974 nt7.57□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 MEP1YGR121C 1479 nt7.57□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 PHB2YGR231C 933 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 YJR149WYJR149W 1215 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 ADH3YMR083W 1128 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 HIS3YOR202W 663 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 SKY1YMR216C 2229 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 YBR056WYBR056W 1506 nt7.56□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 PAR32YDL173W 888 nt7.55□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 PAU5YFL020C 369 nt7.55□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 MEU1YLR017W 1014 nt7.55□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 TPO1YLL028W 1761 nt7.55□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 DAL4YIR028W 1908 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 ADH7YCR105W 1086 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 LYS20YDL182W 1287 nt7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms