RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
YLR349WYLR349W INO80P53115 1489 aa20.42■□□□□ 0.86
YLR349WYLR349W DNA2P38859 1522 aa19.51■□□□□ 0.71
YLR349WYLR349W SWR1Q05471 1514 aa19.41■□□□□ 0.7
YLR349WYLR349W KOG1P38873 1557 aa19.15■□□□□ 0.66
YLR349WYLR349W TY1B-DR4Q07793 1604 aa19.11■□□□□ 0.65
YLR349WYLR349W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
YLR349WYLR349W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
YLR349WYLR349W SGS1P35187 1447 aa18.56■□□□□ 0.56
YLR349WYLR349W HSL1P34244 1518 aa18.39■□□□□ 0.54
YLR349WYLR349W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
YLR349WYLR349W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
YLR349WYLR349W ECM5Q03214 1411 aa18.06■□□□□ 0.48
YLR349WYLR349W HIR3P47171 1648 aa17.97■□□□□ 0.47
YLR349WYLR349W BUD4P47136 1447 aa17.88■□□□□ 0.45
YLR349WYLR349W THO2P53552 1597 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
YLR349WYLR349W MTC1P47018 478 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
YLR349WYLR349W MDS3P53094 1487 aa17.78■□□□□ 0.44
YLR349WYLR349W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
YLR349WYLR349W PEP1P32319 1579 aa17.56■□□□□ 0.4
YLR349WYLR349W REV3P14284 1504 aa17.47■□□□□ 0.39
YLR349WYLR349W ATG2P53855 1592 aa17.41■□□□□ 0.38
YLR349WYLR349W BPT1P14772 1559 aa17.32■□□□□ 0.36
YLR349WYLR349W TAF2P23255 1407 aa17.07■□□□□ 0.32
YLR349WYLR349W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
YLR349WYLR349W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
YLR349WYLR349W SSK2P53599 1579 aa16.99■□□□□ 0.31
YLR349WYLR349W SSN2P38931 1420 aa16.96■□□□□ 0.31
YLR349WYLR349W SIN3P22579 1536 aa16.96■□□□□ 0.31
YLR349WYLR349W ESP1Q03018 1630 aa16.81■□□□□ 0.28
YLR349WYLR349W UFD4P33202 1483 aa16.77■□□□□ 0.28
YLR349WYLR349W SCC2Q04002 1493 aa16.61■□□□□ 0.25
YLR349WYLR349W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
YLR349WYLR349W CDC25P04821 1589 aa16.56■□□□□ 0.24
YLR349WYLR349W DNF1P32660 1571 aa16.56■□□□□ 0.24
YLR349WYLR349W YPK9Q12697 1472 aa16.54■□□□□ 0.24
YLR349WYLR349W MIF2P35201 549 aa16.52■□□□□ 0.24
YLR349WYLR349W CHD1P32657 1468 aa16.51■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-FP0CX63 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-CP25384 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-DR2Q03494 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY1B-DR1Q03855 1755 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-OR1Q12113 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-DR1Q12472 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY2B-OR2Q12501 1770 aa16.49■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W MET5P47169 1442 aa16.47■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W RPO31P04051 1460 aa16.46■□□□□ 0.23
YLR349WYLR349W TY1B-BRQ12193 1756 aa16.46■□□□□ 0.22
YLR349WYLR349W TY1B-GR3Q12316 1755 aa16.46■□□□□ 0.22
YLR349WYLR349W TY1B-ORQ92393 1755 aa16.46■□□□□ 0.22
YLR349WYLR349W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
YLR349WYLR349W RKR1Q04781 1562 aa16.38■□□□□ 0.21
YLR349WYLR349W LTE1P07866 1435 aa16.37■□□□□ 0.21
YLR349WYLR349W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
YLR349WYLR349W BNI1P41832 1953 aa16.35■□□□□ 0.21
YLR349WYLR349W PAN1P32521 1480 aa16.33■□□□□ 0.2
YLR349WYLR349W DRS1P32892 752 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
YLR349WYLR349W TY2B-BQ12491 1770 aa16.27■□□□□ 0.2
YLR349WYLR349W TY1B-HO13535 1793 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-JR1P47098 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-ER1Q03612 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-GR2Q12269 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-OLQ12273 1755 aa16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
YLR349WYLR349W TY1B-DR3Q99231 1755 aa16.21■□□□□ 0.18
YLR349WYLR349W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
YLR349WYLR349W ITT1Q04638 464 aa16.16■□□□□ 0.18
YLR349WYLR349W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
YLR349WYLR349W MMS22Q06164 1454 aa16.1■□□□□ 0.17
YLR349WYLR349W ABP1P15891 592 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
YLR349WYLR349W YRF1-1P0CX20 1796 aa16.05■□□□□ 0.16
YLR349WYLR349W YRF1-5P0CX21 1796 aa16.05■□□□□ 0.16
YLR349WYLR349W YRF1-8P0CX22 1796 aa16.05■□□□□ 0.16
YLR349WYLR349W TRM732Q03496 1420 aa16.04■□□□□ 0.16
YLR349WYLR349W MMS1Q06211 1407 aa16.02■□□□□ 0.15
YLR349WYLR349W YFR006WP43590 535 aa15.99■□□□□ 0.15
YLR349WYLR349W NUP159P40477 1460 aa15.94■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W VPS15P22219 1454 aa15.93■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W IRC20Q06554 1556 aa15.92■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-ER2Q03619 1755 aa15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-MR1Q04214 1755 aa15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-NL1Q12112 1755 aa15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-GR1Q12141 1755 aa15.91■□□□□ 0.14
YLR349WYLR349W TY1B-BLQ12490 1755 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.9 ms