RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C SGS1P35187 1447 aa11.71□□□□□ -0.53
YKR018CYKR018C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
YKR018CYKR018C SSN2P38931 1420 aa11.53□□□□□ -0.56
YKR018CYKR018C INO80P53115 1489 aa11.25□□□□□ -0.61
YKR018CYKR018C DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
YKR018CYKR018C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
YKR018CYKR018C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
YKR018CYKR018C TY1B-DR4Q07793 1604 aa10.8□□□□□ -0.68
YKR018CYKR018C HSL1P34244 1518 aa10.73□□□□□ -0.69
YKR018CYKR018C MMS22Q06164 1454 aa10.66□□□□□ -0.7
YKR018CYKR018C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
YKR018CYKR018C CHD1P32657 1468 aa10.63□□□□□ -0.71
YKR018CYKR018C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
YKR018CYKR018C HIR3P47171 1648 aa10.57□□□□□ -0.72
YKR018CYKR018C NOP2P40991 618 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
YKR018CYKR018C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.52□□□□□ -0.72not detected
YKR018CYKR018C REV3P14284 1504 aa10.48□□□□□ -0.73
YKR018CYKR018C THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
YKR018CYKR018C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
YKR018CYKR018C UFD4P33202 1483 aa10.43□□□□□ -0.74
YKR018CYKR018C SSK2P53599 1579 aa10.43□□□□□ -0.74
YKR018CYKR018C SIN3P22579 1536 aa10.43□□□□□ -0.74
YKR018CYKR018C TAF2P23255 1407 aa10.34□□□□□ -0.75
YKR018CYKR018C TRM732Q03496 1420 aa10.33□□□□□ -0.76
YKR018CYKR018C STU1P38198 1513 aa10.32□□□□□ -0.76
YKR018CYKR018C ESP1Q03018 1630 aa10.32□□□□□ -0.76
YKR018CYKR018C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YKR018CYKR018C BPT1P14772 1559 aa10.26□□□□□ -0.77
YKR018CYKR018C POL1P13382 1468 aa10.26□□□□□ -0.77
YKR018CYKR018C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
YKR018CYKR018C SWR1Q05471 1514 aa10.23□□□□□ -0.77
YKR018CYKR018C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
YKR018CYKR018C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YKR018CYKR018C SCC2Q04002 1493 aa10.18□□□□□ -0.78
YKR018CYKR018C YTA7P40340 1379 aa10.18□□□□□ -0.78
YKR018CYKR018C SPP41P38904 1435 aa10.16□□□□□ -0.78
YKR018CYKR018C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YKR018CYKR018C NUP170P38181 1502 aa10.12□□□□□ -0.79
YKR018CYKR018C SSM4P40318 1319 aa10.09□□□□□ -0.79
YKR018CYKR018C ECM5Q03214 1411 aa10.09□□□□□ -0.79
YKR018CYKR018C RKR1Q04781 1562 aa10.07□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C YPK9Q12697 1472 aa10.07□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C MYO4P32492 1471 aa10.05□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C DNA2P38859 1522 aa10.05□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C YOR1P53049 1477 aa10.05□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C ATG2P53855 1592 aa10.05□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C ENP1P38333 483 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
YKR018CYKR018C BUD4P47136 1447 aa10□□□□□ -0.81
YKR018CYKR018C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
YKR018CYKR018C MLP2P40457 1679 aa9.98□□□□□ -0.81
YKR018CYKR018C POL5P39985 1022 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C STH1P32597 1359 aa9.94□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C SPT7P35177 1332 aa9.93□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C PDR10P51533 1564 aa9.91□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
YKR018CYKR018C TY1B-DR3Q99231 1755 aa9.89□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C PAN1P32521 1480 aa9.89□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C SMC4Q12267 1418 aa9.88□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C KOG1P38873 1557 aa9.88□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C PEP1P32319 1579 aa9.87□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C RPO31P04051 1460 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-FP0CX63 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-CP25384 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-DR2Q03494 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY1B-DR1Q03855 1755 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-OR1Q12113 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-DR1Q12472 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TY2B-OR2Q12501 1770 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C ULS1Q08562 1619 aa9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C RTT106P40161 455 aa9.85□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TAF7Q05021 590 aa9.85□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C TSC11P40061 1430 aa9.84□□□□□ -0.83
YKR018CYKR018C IFH1P39520 1085 aa9.82□□□□□ -0.84
YKR018CYKR018C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YKR018CYKR018C TY3B-GQ99315 1547 aa9.81□□□□□ -0.84
YKR018CYKR018C TY2B-BQ12491 1770 aa9.8□□□□□ -0.84
YKR018CYKR018C PRS1P32895 427 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
YKR018CYKR018C YBT1P32386 1661 aa9.71□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C MDS3P53094 1487 aa9.7□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C DNF1P32660 1571 aa9.69□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C VPS15P22219 1454 aa9.69□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C YPR148CQ06523 435 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-HO13535 1793 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-JR1P47098 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-ER1Q03612 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
YKR018CYKR018C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms