Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF4Q08170 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF4Q08170 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF4Q08170 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF4Q08170 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms