Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FMODQ06828 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FMODQ06828 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FMODQ06828 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FMODQ06828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMODQ06828 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMODQ06828 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FMODQ06828 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FMODQ06828 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMODQ06828 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMODQ06828 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMODQ06828 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMODQ06828 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FMODQ06828 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FMODQ06828 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMODQ06828 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FMODQ06828 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FMODQ06828 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMODQ06828 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FMODQ06828 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMODQ06828 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMODQ06828 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMODQ06828 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMODQ06828 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FMODQ06828 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FMODQ06828 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FMODQ06828 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FMODQ06828 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FMODQ06828 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FMODQ06828 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMODQ06828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMODQ06828 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMODQ06828 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FMODQ06828 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMODQ06828 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMODQ06828 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMODQ06828 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMODQ06828 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FMODQ06828 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMODQ06828 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMODQ06828 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMODQ06828 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMODQ06828 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FMODQ06828 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FMODQ06828 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FMODQ06828 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FMODQ06828 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FMODQ06828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FMODQ06828 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FMODQ06828 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FMODQ06828 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FMODQ06828 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FMODQ06828 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FMODQ06828 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FMODQ06828 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FMODQ06828 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FMODQ06828 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FMODQ06828 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FMODQ06828 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FMODQ06828 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FMODQ06828 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FMODQ06828 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FMODQ06828 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FMODQ06828 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FMODQ06828 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FMODQ06828 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FMODQ06828 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FMODQ06828 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FMODQ06828 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FMODQ06828 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FMODQ06828 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms