Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-205ENST00000470290 760 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 NOL11-207ENST00000581966 476 ntTSL 512.57□□□□□ -0.45e-12■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 NOL11-205ENST00000581106 584 ntTSL 312.37□□□□□ -0.435e-12■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 45.7
FMR1Q06787 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 45.7
FMR1Q06787 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 45.7
FMR1Q06787 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 45.7
FMR1Q06787 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.63e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.53e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.533e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.443e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 212.7□□□□□ -0.383e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-216ENST00000442834 2508 ntTSL 212.39□□□□□ -0.433e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.813e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC9.38□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 45.6
FMR1Q06787 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 45.5
FMR1Q06787 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.987e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.837e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.587e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.567e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.257e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.27e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.127e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.197e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.037e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 514.46□□□□□ -0.097e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 312.35□□□□□ -0.437e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 XPO5-212ENST00000612911 911 ntTSL 211.38□□□□□ -0.597e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.627e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.627e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.657e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.677e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 310.59□□□□□ -0.717e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 XPO5-203ENST00000398835 868 ntTSL 510.43□□□□□ -0.747e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 410.23□□□□□ -0.777e-13■■■■■ 45.3
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.842e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 223.52■■□□□ 1.362e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 322.46■■□□□ 1.192e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 321.18■□□□□ 0.982e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 420.83■□□□□ 0.932e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 413.55□□□□□ -0.242e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 313.35□□□□□ -0.272e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 413.12□□□□□ -0.312e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.742e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-24■■■■■ 44.8
FMR1Q06787 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.495e-6■■■■■ 44.7
FMR1Q06787 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 323.77■■□□□ 1.41e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 323.76■■□□□ 1.391e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.031e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 AC003006.1-201ENST00000599221 421 ntTSL 318.27■□□□□ 0.521e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 PVT1-208ENST00000519481 542 ntTSL 213.97□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 RAE1-207ENST00000462438 3251 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-24■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 PVT1-206ENST00000517838 518 ntTSL 29.73□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 TRIM37-213ENST00000585287 634 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 LRRC59-202ENST00000503118 438 ntTSL 58.94□□□□□ -0.985e-24■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.33□□□□□ -1.45e-24■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 TRIM37-211ENST00000583945 430 ntTSL 36.03□□□□□ -1.441e-12■■■■■ 44.3
FMR1Q06787 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 533.57■■■□□ 2.964e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.974e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 326.56■■□□□ 1.844e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.468e-8■■■■■ 44.2
FMR1Q06787 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.276e-18■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.156e-18■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 44.1
FMR1Q06787 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-8■■■■■ 44.1
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 413.6 ms