Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CRB1P82279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CRB1P82279 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CRB1P82279 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CRB1P82279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CRB1P82279 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CRB1P82279 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CRB1P82279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CRB1P82279 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CRB1P82279 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CRB1P82279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CRB1P82279 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CRB1P82279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CRB1P82279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CRB1P82279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CRB1P82279 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CRB1P82279 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CRB1P82279 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CRB1P82279 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CRB1P82279 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CRB1P82279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CRB1P82279 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CRB1P82279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CRB1P82279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CRB1P82279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CRB1P82279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CRB1P82279 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CRB1P82279 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CRB1P82279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CRB1P82279 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CRB1P82279 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CRB1P82279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CRB1P82279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CRB1P82279 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CRB1P82279 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CRB1P82279 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CRB1P82279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CRB1P82279 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CRB1P82279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CRB1P82279 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CRB1P82279 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CRB1P82279 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CRB1P82279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
CRB1P82279 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CRB1P82279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CRB1P82279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRB1P82279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRB1P82279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRB1P82279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRB1P82279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CRB1P82279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CRB1P82279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CRB1P82279 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CRB1P82279 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CRB1P82279 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CRB1P82279 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CRB1P82279 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CRB1P82279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CRB1P82279 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CRB1P82279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CRB1P82279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CRB1P82279 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CRB1P82279 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CRB1P82279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CRB1P82279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CRB1P82279 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CRB1P82279 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CRB1P82279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CRB1P82279 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CRB1P82279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CRB1P82279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CRB1P82279 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CRB1P82279 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CRB1P82279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CRB1P82279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CRB1P82279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CRB1P82279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CRB1P82279 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CRB1P82279 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CRB1P82279 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CRB1P82279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CRB1P82279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CRB1P82279 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms