Protein–RNA interactions for Protein: P78560

CRADD, Death domain-containing protein CRADD, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRADDP78560 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRADDP78560 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRADDP78560 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRADDP78560 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRADDP78560 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRADDP78560 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRADDP78560 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRADDP78560 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRADDP78560 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRADDP78560 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRADDP78560 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRADDP78560 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRADDP78560 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRADDP78560 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRADDP78560 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRADDP78560 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRADDP78560 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRADDP78560 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRADDP78560 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRADDP78560 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRADDP78560 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRADDP78560 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRADDP78560 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CRADDP78560 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRADDP78560 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRADDP78560 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRADDP78560 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CRADDP78560 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRADDP78560 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRADDP78560 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRADDP78560 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRADDP78560 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRADDP78560 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRADDP78560 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRADDP78560 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CRADDP78560 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRADDP78560 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CRADDP78560 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRADDP78560 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRADDP78560 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRADDP78560 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRADDP78560 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRADDP78560 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRADDP78560 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRADDP78560 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRADDP78560 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRADDP78560 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRADDP78560 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRADDP78560 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRADDP78560 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRADDP78560 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRADDP78560 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRADDP78560 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRADDP78560 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRADDP78560 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRADDP78560 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRADDP78560 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms