Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS25P62851 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS25P62851 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS25P62851 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS25P62851 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS25P62851 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS25P62851 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS25P62851 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS25P62851 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS25P62851 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS25P62851 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS25P62851 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS25P62851 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS25P62851 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS25P62851 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS25P62851 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS25P62851 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS25P62851 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS25P62851 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS25P62851 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS25P62851 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS25P62851 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS25P62851 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS25P62851 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS25P62851 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS25P62851 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS25P62851 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS25P62851 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS25P62851 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS25P62851 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS25P62851 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS25P62851 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS25P62851 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS25P62851 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS25P62851 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS25P62851 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS25P62851 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS25P62851 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS25P62851 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS25P62851 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS25P62851 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS25P62851 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS25P62851 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS25P62851 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS25P62851 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS25P62851 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS25P62851 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS25P62851 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS25P62851 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS25P62851 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS25P62851 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS25P62851 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS25P62851 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS25P62851 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS25P62851 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS25P62851 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS25P62851 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS25P62851 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS25P62851 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS25P62851 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS25P62851 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS25P62851 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS25P62851 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS25P62851 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS25P62851 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS25P62851 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS25P62851 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS25P62851 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS25P62851 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS25P62851 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS25P62851 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS25P62851 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms