Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTBP60709 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTBP60709 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTBP60709 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTBP60709 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTBP60709 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTBP60709 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTBP60709 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTBP60709 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTBP60709 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTBP60709 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTBP60709 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTBP60709 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTBP60709 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTBP60709 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTBP60709 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTBP60709 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTBP60709 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTBP60709 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTBP60709 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTBP60709 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTBP60709 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTBP60709 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTBP60709 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTBP60709 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTBP60709 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTBP60709 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTBP60709 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTBP60709 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTBP60709 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTBP60709 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTBP60709 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTBP60709 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTBP60709 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTBP60709 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTBP60709 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTBP60709 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTBP60709 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTBP60709 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTBP60709 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTBP60709 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTBP60709 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTBP60709 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTBP60709 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTBP60709 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTBP60709 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTBP60709 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTBP60709 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTBP60709 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTBP60709 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTBP60709 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTBP60709 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTBP60709 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTBP60709 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTBP60709 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTBP60709 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTBP60709 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTBP60709 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTBP60709 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTBP60709 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTBP60709 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTBP60709 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTBP60709 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTBP60709 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTBP60709 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTBP60709 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTBP60709 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTBP60709 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms