Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF3P57682 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF3P57682 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF3P57682 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF3P57682 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF3P57682 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF3P57682 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF3P57682 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF3P57682 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF3P57682 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF3P57682 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF3P57682 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF3P57682 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLF3P57682 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLF3P57682 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF3P57682 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF3P57682 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF3P57682 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF3P57682 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF3P57682 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF3P57682 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF3P57682 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF3P57682 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF3P57682 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF3P57682 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF3P57682 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF3P57682 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF3P57682 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF3P57682 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF3P57682 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF3P57682 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF3P57682 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF3P57682 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF3P57682 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF3P57682 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF3P57682 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF3P57682 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF3P57682 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF3P57682 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF3P57682 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF3P57682 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF3P57682 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF3P57682 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF3P57682 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF3P57682 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF3P57682 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF3P57682 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF3P57682 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF3P57682 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF3P57682 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF3P57682 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms