Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSCP56915 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GSCP56915 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSCP56915 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSCP56915 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSCP56915 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSCP56915 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSCP56915 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSCP56915 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSCP56915 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GSCP56915 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSCP56915 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSCP56915 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSCP56915 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSCP56915 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSCP56915 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSCP56915 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSCP56915 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSCP56915 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSCP56915 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSCP56915 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSCP56915 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GSCP56915 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GSCP56915 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSCP56915 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSCP56915 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSCP56915 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSCP56915 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSCP56915 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GSCP56915 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GSCP56915 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSCP56915 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GSCP56915 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSCP56915 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSCP56915 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSCP56915 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSCP56915 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSCP56915 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSCP56915 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSCP56915 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GSCP56915 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GSCP56915 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSCP56915 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSCP56915 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSCP56915 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSCP56915 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSCP56915 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSCP56915 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSCP56915 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSCP56915 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSCP56915 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSCP56915 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSCP56915 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSCP56915 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSCP56915 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSCP56915 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSCP56915 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSCP56915 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSCP56915 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSCP56915 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSCP56915 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GSCP56915 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GSCP56915 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSCP56915 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSCP56915 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms