Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3BP55884 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3BP55884 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3BP55884 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF3BP55884 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms