Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH13P55290 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH13P55290 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH13P55290 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH13P55290 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH13P55290 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH13P55290 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH13P55290 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH13P55290 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH13P55290 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH13P55290 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH13P55290 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH13P55290 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH13P55290 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH13P55290 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH13P55290 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH13P55290 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH13P55290 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH13P55290 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH13P55290 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH13P55290 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH13P55290 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH13P55290 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH13P55290 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH13P55290 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH13P55290 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH13P55290 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH13P55290 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH13P55290 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH13P55290 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH13P55290 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH13P55290 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH13P55290 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH13P55290 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH13P55290 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH13P55290 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH13P55290 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH13P55290 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH13P55290 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH13P55290 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH13P55290 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH13P55290 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH13P55290 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH13P55290 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH13P55290 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH13P55290 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH13P55290 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH13P55290 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH13P55290 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH13P55290 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH13P55290 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH13P55290 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH13P55290 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH13P55290 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH13P55290 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH13P55290 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH13P55290 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH13P55290 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH13P55290 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH13P55290 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH13P55290 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH13P55290 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH13P55290 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH13P55290 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH13P55290 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH13P55290 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH13P55290 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH13P55290 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH13P55290 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms