Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH11P55287 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH11P55287 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH11P55287 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH11P55287 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH11P55287 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH11P55287 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH11P55287 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH11P55287 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH11P55287 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH11P55287 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH11P55287 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH11P55287 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH11P55287 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH11P55287 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH11P55287 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH11P55287 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH11P55287 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH11P55287 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH11P55287 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH11P55287 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH11P55287 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH11P55287 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH11P55287 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH11P55287 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH11P55287 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH11P55287 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH11P55287 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH11P55287 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH11P55287 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH11P55287 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH11P55287 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH11P55287 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH11P55287 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH11P55287 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH11P55287 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH11P55287 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH11P55287 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH11P55287 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH11P55287 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH11P55287 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH11P55287 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH11P55287 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH11P55287 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH11P55287 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH11P55287 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH11P55287 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH11P55287 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH11P55287 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH11P55287 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH11P55287 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms