Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRISP3P54108 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRISP3P54108 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP3P54108 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRISP3P54108 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP3P54108 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms