Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV1P50549 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV1P50549 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV1P50549 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV1P50549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ETV1P50549 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ETV1P50549 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV1P50549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV1P50549 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETV1P50549 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV1P50549 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETV1P50549 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV1P50549 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV1P50549 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV1P50549 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV1P50549 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETV1P50549 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV1P50549 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV1P50549 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETV1P50549 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ETV1P50549 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETV1P50549 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV1P50549 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV1P50549 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV1P50549 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETV1P50549 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV1P50549 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETV1P50549 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV1P50549 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV1P50549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETV1P50549 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV1P50549 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETV1P50549 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV1P50549 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV1P50549 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETV1P50549 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETV1P50549 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV1P50549 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV1P50549 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETV1P50549 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV1P50549 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETV1P50549 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ETV1P50549 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV1P50549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV1P50549 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV1P50549 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV1P50549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV1P50549 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV1P50549 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV1P50549 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETV1P50549 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV1P50549 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV1P50549 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ETV1P50549 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ETV1P50549 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV1P50549 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ETV1P50549 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ETV1P50549 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV1P50549 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV1P50549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV1P50549 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ETV1P50549 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms